MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 52924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017999	CGC	2	6	89	94	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935918
2	NC_017999	GCA	2	6	177	182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
3	NC_017999	GCT	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935918
4	NC_017999	CTC	2	6	272	277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935918
5	NC_017999	GCC	2	6	300	305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935918
6	NC_017999	GCG	2	6	328	333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935918
7	NC_017999	TCC	2	6	424	429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935918
8	NC_017999	TCGAT	2	10	431	440	20 %	40 %	20 %	20 %	390935918
9	NC_017999	CTC	2	6	485	490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935918
10	NC_017999	GCA	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
11	NC_017999	CGTT	2	8	581	588	0 %	50 %	25 %	25 %	390935918
12	NC_017999	CGCA	2	8	609	616	25 %	0 %	25 %	50 %	390935918
13	NC_017999	CGG	2	6	675	680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935918
14	NC_017999	CCG	2	6	846	851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935918
15	NC_017999	CGA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
16	NC_017999	CGG	2	6	897	902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935918
17	NC_017999	TTC	2	6	925	930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935918
18	NC_017999	CA	3	6	931	936	50 %	0 %	0 %	50 %	390935918
19	NC_017999	CAA	2	6	957	962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935918
20	NC_017999	GCC	2	6	1062	1067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935918
21	NC_017999	ATG	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935918
22	NC_017999	CG	3	6	1243	1248	0 %	0 %	50 %	50 %	390935918
23	NC_017999	CTT	2	6	1272	1277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935918
24	NC_017999	CAC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935918
25	NC_017999	CCGA	2	8	1300	1307	25 %	0 %	25 %	50 %	390935918
26	NC_017999	CAT	2	6	1308	1313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935918
27	NC_017999	CGA	2	6	1347	1352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
28	NC_017999	TCG	2	6	1355	1360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935918
29	NC_017999	GC	4	8	1362	1369	0 %	0 %	50 %	50 %	390935918
30	NC_017999	CGG	2	6	1461	1466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935918
31	NC_017999	CAC	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935918
32	NC_017999	GAT	2	6	1510	1515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935918
33	NC_017999	CG	3	6	1560	1565	0 %	0 %	50 %	50 %	390935918
34	NC_017999	AGC	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
35	NC_017999	GAC	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
36	NC_017999	TC	3	6	1603	1608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017999	A	6	6	1652	1657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017999	T	6	6	1662	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017999	CTG	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017999	ATA	2	6	1737	1742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017999	ACAT	2	8	1746	1753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017999	CTG	2	6	1796	1801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017999	ACT	2	6	1867	1872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017999	T	6	6	1878	1883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017999	TTA	2	6	2061	2066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017999	CGT	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017999	GAT	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017999	A	6	6	2128	2133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017999	GAC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
50	NC_017999	CAC	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935919
51	NC_017999	CGA	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
52	NC_017999	CTC	2	6	2407	2412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935919
53	NC_017999	CTGC	2	8	2431	2438	0 %	25 %	25 %	50 %	390935919
54	NC_017999	ACCT	2	8	2446	2453	25 %	25 %	0 %	50 %	390935919
55	NC_017999	CGAC	2	8	2456	2463	25 %	0 %	25 %	50 %	390935919
56	NC_017999	CCA	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935919
57	NC_017999	GAG	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935919
58	NC_017999	CGAC	2	8	2693	2700	25 %	0 %	25 %	50 %	390935919
59	NC_017999	CGC	2	6	2735	2740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935919
60	NC_017999	CGT	2	6	2823	2828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935919
61	NC_017999	GCT	2	6	2856	2861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935919
62	NC_017999	CGA	2	6	2940	2945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
63	NC_017999	AGC	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
64	NC_017999	AACGC	2	10	3017	3026	40 %	0 %	20 %	40 %	390935919
65	NC_017999	CCG	2	6	3068	3073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935919
66	NC_017999	CAG	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
67	NC_017999	CGA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
68	NC_017999	CGAAT	2	10	3340	3349	40 %	20 %	20 %	20 %	390935920
69	NC_017999	CCG	2	6	3358	3363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935920
70	NC_017999	AC	3	6	3366	3371	50 %	0 %	0 %	50 %	390935920
71	NC_017999	ATGAC	2	10	3382	3391	40 %	20 %	20 %	20 %	390935920
72	NC_017999	TCG	2	6	3518	3523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935921
73	NC_017999	GCG	2	6	3590	3595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935921
74	NC_017999	CGA	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
75	NC_017999	TGA	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935921
76	NC_017999	ACC	3	9	3721	3729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935921
77	NC_017999	CGG	2	6	3777	3782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935921
78	NC_017999	GGA	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935921
79	NC_017999	CAG	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
80	NC_017999	GGCG	2	8	3858	3865	0 %	0 %	75 %	25 %	390935921
81	NC_017999	CCG	2	6	3869	3874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935921
82	NC_017999	TCA	2	6	3887	3892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935921
83	NC_017999	GTC	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935921
84	NC_017999	CTG	2	6	3907	3912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935921
85	NC_017999	CACG	2	8	3945	3952	25 %	0 %	25 %	50 %	390935921
86	NC_017999	GGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935921
87	NC_017999	CGC	2	6	4020	4025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935921
88	NC_017999	CAT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935921
89	NC_017999	GGCG	2	8	4155	4162	0 %	0 %	75 %	25 %	390935921
90	NC_017999	TGG	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935921
91	NC_017999	GCAG	2	8	4212	4219	25 %	0 %	50 %	25 %	390935921
92	NC_017999	CGA	2	6	4242	4247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
93	NC_017999	GGT	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935921
94	NC_017999	CGA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
95	NC_017999	CGA	2	6	4515	4520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
96	NC_017999	CGC	2	6	4525	4530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935921
97	NC_017999	CCGCGG	2	12	4577	4588	0 %	0 %	50 %	50 %	390935921
98	NC_017999	CGA	2	6	4680	4685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
99	NC_017999	CGGG	2	8	4741	4748	0 %	0 %	75 %	25 %	390935922
100	NC_017999	GGA	2	6	4896	4901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935922
101	NC_017999	GAT	2	6	4913	4918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935922
102	NC_017999	GGT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935922
103	NC_017999	ACCT	2	8	5160	5167	25 %	25 %	0 %	50 %	390935922
104	NC_017999	AG	3	6	5294	5299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017999	ATA	2	6	5332	5337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017999	AAC	2	6	5392	5397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017999	AGGA	2	8	5420	5427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017999	AGC	2	6	5523	5528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
109	NC_017999	AGC	2	6	5533	5538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
110	NC_017999	GAC	2	6	5595	5600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
111	NC_017999	CG	3	6	5701	5706	0 %	0 %	50 %	50 %	390935923
112	NC_017999	CAC	2	6	5712	5717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935923
113	NC_017999	TCG	2	6	5731	5736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935923
114	NC_017999	CGA	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
115	NC_017999	CGT	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935923
116	NC_017999	GAC	2	6	5820	5825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
117	NC_017999	CGA	2	6	5843	5848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
118	NC_017999	TGA	2	6	5884	5889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935923
119	NC_017999	CGG	2	6	5903	5908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
120	NC_017999	CGG	4	12	5915	5926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
121	NC_017999	CGG	2	6	5939	5944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
122	NC_017999	GCG	2	6	6005	6010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
123	NC_017999	GCG	2	6	6129	6134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
124	NC_017999	CAG	2	6	6183	6188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
125	NC_017999	TCAC	2	8	6219	6226	25 %	25 %	0 %	50 %	390935923
126	NC_017999	CGA	2	6	6254	6259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
127	NC_017999	GAG	2	6	6378	6383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935923
128	NC_017999	ACC	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935923
129	NC_017999	CCA	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935923
130	NC_017999	GCAC	2	8	6511	6518	25 %	0 %	25 %	50 %	390935923
131	NC_017999	GAA	2	6	6519	6524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935923
132	NC_017999	CGA	2	6	6611	6616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
133	NC_017999	CCG	2	6	6634	6639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935923
134	NC_017999	CTC	2	6	6661	6666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935923
135	NC_017999	TGA	2	6	6730	6735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935923
136	NC_017999	CAT	2	6	6785	6790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935923
137	NC_017999	GAA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935923
138	NC_017999	CGGC	2	8	6874	6881	0 %	0 %	50 %	50 %	390935923
139	NC_017999	TCG	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935923
140	NC_017999	GGC	2	6	6960	6965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
141	NC_017999	ATG	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935923
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143	NC_017999	TCA	3	9	7150	7158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935923
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145	NC_017999	GAT	2	6	7232	7237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935923
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147	NC_017999	ACCG	2	8	7317	7324	25 %	0 %	25 %	50 %	390935923
148	NC_017999	CGA	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
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150	NC_017999	CGA	2	6	7529	7534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
151	NC_017999	CGG	2	6	7619	7624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017999	G	10	10	7623	7632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017999	GGT	2	6	7654	7659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017999	ACG	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017999	ACG	2	6	7779	7784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
156	NC_017999	CGA	2	6	7843	7848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
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159	NC_017999	CGG	2	6	7996	8001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935924
160	NC_017999	ACC	2	6	8064	8069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935924
161	NC_017999	CGC	2	6	8080	8085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935924
162	NC_017999	GGGCA	2	10	8147	8156	20 %	0 %	60 %	20 %	390935924
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168	NC_017999	CTG	2	6	8330	8335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935924
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174	NC_017999	GGT	2	6	8578	8583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935924
175	NC_017999	GAG	2	6	8591	8596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935924
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239	NC_017999	CGA	2	6	11076	11081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935925
240	NC_017999	TCA	2	6	11154	11159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_017999	CCG	2	6	11184	11189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
242	NC_017999	AGG	2	6	11219	11224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
243	NC_017999	GAC	2	6	11300	11305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_017999	AAT	2	6	11307	11312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_017999	GAT	2	6	11323	11328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
246	NC_017999	TGT	2	6	11344	11349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_017999	TTG	2	6	11395	11400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
248	NC_017999	TCA	2	6	11509	11514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935926
249	NC_017999	GCG	2	6	11518	11523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935926
250	NC_017999	TCG	2	6	11554	11559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935926
251	NC_017999	TCG	2	6	11581	11586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935926
252	NC_017999	GGC	2	6	11590	11595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935926
253	NC_017999	GACG	2	8	11610	11617	25 %	0 %	50 %	25 %	390935926
254	NC_017999	CAT	2	6	11660	11665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935926
255	NC_017999	ACC	2	6	11818	11823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935927
256	NC_017999	ACC	2	6	11857	11862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935927
257	NC_017999	CGC	2	6	11883	11888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935927
258	NC_017999	CGA	2	6	11955	11960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935927
259	NC_017999	ACC	2	6	12001	12006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935927
260	NC_017999	CGC	2	6	12072	12077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935927
261	NC_017999	AGG	2	6	12080	12085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935927
262	NC_017999	CAA	2	6	12093	12098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935927
263	NC_017999	CGA	2	6	12111	12116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935927
264	NC_017999	GAAGCC	2	12	12167	12178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935927
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267	NC_017999	AAG	2	6	12303	12308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_017999	ACA	2	6	17197	17202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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389	NC_017999	CA	3	6	17654	17659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
390	NC_017999	GCAGT	2	10	17663	17672	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
391	NC_017999	CGC	2	6	17737	17742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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